Au cours de sa carrière, Arnaud Fontanet, épidémiologiste à l'Institut Pasteur, a été confronté à bien des maladies. Au quotidien, il tente de comprendre les causes et les facteurs favorisant l'apparition de virus émergents. Mais parfois, certaines pathologies s'abattent sur des populations, sans explication apparente.

Dans cet épisode, le chercheur raconte une histoire qui l'a particulièrement marqué. Tout commence à la fin des années 90 par une alerte : au Vietnam, une mystérieuse épidémie d'encéphalites touche de nombreux enfants. Elle est mortelle. Arnaud Fontanet se rend sur place pour trouver le foyer suspect.