Grâce à la ligature, chaque bonsaïka exprime sa propre sensibilité, car cette technique permet la mise en forme des branches et du tronc d'un futur bonsaï. La ligature entraîne un effet physiologique sur l'arbre: au cours de la mise en forme, le cambium émet des cellules cicatricielles bloquant le bois dans la position désirée, sans aucun stress pour l'arbre.
L'arbre, continuellement exposé à des stimuli mécaniques, produit une hormone végétale: l'éthylène. Cette hormone contrôle le développement des cellules, ralentissant l'allongement des branches et l'extension des feuilles. De ce fait, la ligature a un effet sur le feuillage, en raccourcissant les aiguilles des conifères et diminuant les feuilles des feuillus. Un autre effet de l'éthylène est de favoriser la ramification, en provoquant le réveil des bourgeons au niveau des
